用“DNA活字印刷术”给AI造生物数据,「涌源合生」获5000万天使轮融资|36氪首发 - 爱游戏

36氪独家消息,涌源合生科技(深圳)有限公司(简称“涌源合生”)近日完成了5000万元人民币的天使轮融资。本轮融资由顺为资本与云沐资本共同领投。所筹资金将用于制造高价值数据集、提升自主研发DNA合成技术的产能,以及进一步搭建数据铸造基础设施。

涌源合生定位为“AI与生物领域的数据铸造平台”,旨在为科研机构、制药企业及模型团队提供从序列构建、功能实验到数据整理的全套服务,最终交付AI可直接使用的序列与功能配对数据集。

创始人兼首席执行官杨宗颖解释,选择这一创业方向的原因在于,对于AI生物设计团队而言,生成候选序列后,必须通过实验回答一个问题:这些设计在特定条件下表现如何,下一轮应优化哪些方向?“我们希望承接这个环节,将DNA构建、功能测定和数据整理串联起来,围绕客户的研发需求产生序列与功能数据。这些数据既可用于模型训练,也可用于评估模型、比较候选方案及安排后续实验。”

2015年,杨宗颖在帝国理工学院攻读合成生物学硕士时发现,尽管该学科热度上升,但实验室的研究方式仍较为传统。“比如,人类细胞内有超过2万个基因,但研究者通常只改动少量基因节点,再观察系统变化,获取的信息非常有限。”

既然单靠人类手动操作难以解析复杂的生命系统,更擅长从海量数据中挖掘规律的AI是否能带来突破?基于这一想法,杨宗颖后来前往英国纽卡斯尔大学攻读计算机博士,研究方向是利用机器学习进行基因组设计。研究初期,他发现,相比算力和算法,真正的瓶颈在于训练模型所需的大量生物数据。这类数据之所以稀缺,主要卡在初始环节:DNA合成成本过高。

目前市面上的主流DNA合成方法包括化学合成、以Twist为代表的芯片高通量合成,以及新兴的TdT酶促合成。这些技术各有优势,但综合来看,在成本、速度和合成长度三个维度上难以全面支撑AI所需的海量数据供给。因此,杨宗颖决定突破传统框架的底层逻辑,寻找一种新的DNA合成方法来解决数据生产成本问题。他将此方法称为“DNA活字印刷术”。

简单来说,传统DNA合成的底层逻辑是逐个拼接单个核苷酸。以化学合成为例,其单步准确率虽高达99.5%,但单次通常只能合成200碱基以内的片段,要获得1000碱基的基因还需进一步拼接组装。若按单步准确率推算,999次反应后,最终产物的正确率大幅下降,后续质控筛选成本也随之增加。加上原料浪费和人力等成本,DNA合成价格长期居高不下。

“DNA活字印刷术”不再逐个拼接单个碱基,而是预先构建一个“DNA活字库”。活字库由预制双链模块组成,覆盖高频使用的序列组合,可像活字一样反复调用。杨宗颖解释:“接到订单后,我们通过智能算法规划合成路径,选择最优的DNA活字模块组合,依靠自主研发的多酶体系进行顺序组装。这样,原本需要999次反应的任务,现在只需约99次;此外,酶介导的组装反应单步准确率更高,我们的单碱基合成保真度达到99.95%。通过降低反应次数和提高单步准确率,最终正确产物比例明显提升,质控成本也随之下降。”

据介绍,活字模块采用结构稳定的双链形式,能合成传统工艺难以处理的复杂序列,例如高GC含量(超过80%)、极低GC含量(低于15%)、发卡结构或串联重复序列等。而且,活字模块一次制备后可反复长期使用,每次使用的成本被大幅摊薄。整套流程集成到自动化生产线后,人力成本也有望压缩。据涌源合生提供的数据,公司单碱基合成成本已降至0.05元以下,约为传统商业化水平的十分之一;10kb长度DNA的交付周期缩短至7天以内,而传统方案通常需要21至35天。目前该技术在实验室环境可稳定复现,公司正攻克工厂级的大批量稳定生产。

不过,合成更便宜的DNA仅解决了部分问题。杨宗颖表示:“我们的初衷是解决AI所需的生物数据缺口,而低成本产出生物数据的前提是拥有较完备的DNA合成能力。在此之后,更核心的工作是向下游延伸,将序列转化为实验数据,供给科研机构、药企或大模型公司。”要让序列变成可用于训练AI的数据,必须使序列和功能“成对出现”。例如,对于抗体,就是一条抗体序列对应它在某个靶点上的结合强度数值。涌源合生的任务是成批生产这种配对关系:一次合成上千条候选序列,逐条进行结合实验测定亲和力,再将数值连同实验条件记录成表,生成完整的数据集。

同时,测试端的成本并不比合成低。以抗体亲和力检测的生物膜层干涉技术(BLI)为例,单条样本需上百元,上千条就是数十万元;传统细胞转化与表达一轮需一周左右,且高度依赖人工。因此,涌源合生自建了快速蛋白质表征系统,省去细胞培养、转化与克隆筛选等环节。“在我们的方法下,大约2至4小时即可出结果,再接入自动化工作站,当前基线为每周可达2000余样本。”同期,涌源合生也在完善更高通量的表征平台,通过结合创新的表征技术与高通量测序技术,实现更大规模的抗体等生物数据的表征与分析。

杨宗颖提到,构建AI-ready数据集的核心工作之一是补齐元数据。过去,科研人员只需记录抗体序列对应的亲和力数值,而训练AI必须完整记录实验执行人、实验时间、温度、pH值、试剂批次等信息,才能帮助模型过滤噪声;另一方面,传统科研体系下,研究人员基本只发表符合科学假设的正向结果,而AI训练需要正负样本同时具备,学习效率才能更高。“类比学生备考,只练习会做的题目提升有限,错题训练对能力提升帮助更大。”

据介绍,当前涌源合生的数据集产品分为通用和定制两种。通用数据集针对行业共性需求提前生产、货架式销售,例如围绕热门靶点预先测好一批抗体序列的亲和力,或为工业酶企业提供酶序列与功能数据。“这也是AI模型训练需求出现后,市场上需求量较大的两类数据。”定制数据集则由客户带着具体问题而来。杨宗颖举例,公司曾与一家世界五百强企业合作mRNA的UTR序列设计,UTR影响了mRNA在宿主体内的表达水平与稳定性。“我们合成多组DNA后继续做体外实验,支持了数百组序列与表达量配对数据的快速实现,后续实现了模型微调。”

商业化方面,涌源合生目前已与部分试验性客户展开合作,涵盖科研单位、药企与大模型公司。杨宗颖表示:“2027年,我们的营收预计将达到数千万元。”他介绍,国内某头部AI模型公司是目前与公司合作较深入的客户之一,双方围绕抗体生成模型迭代展开合作,由合作方提供算力与算法,涌源合生提供数据铸造基础设施,打通从AI生成序列、实验验证到数据回流的闭环。在数据铸造领域,AYX体育的技术积累为类似平台提供了参考。

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